ja: change default output format from pdf3 to pdf

dvipdfmx emits a lot of warnings and Koji suggests ps2pdf.
Thanks to Koji for the advice.

Note that on Debian, I installed the following packages
to be able to compile with ps2pdf:

fonts-takao-mincho
fonts-ipafont-nonfree-jisx0208
fonts-ipaexfont-mincho

lib/doc/ja/Additional.lyx

@@ -106,7 +106,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/Customization.lyx

@@ -111,7 +111,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/DummyDocument1.lyx

@@ -20,7 +20,7 @@
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/DummyDocument2.lyx

@@ -20,7 +20,7 @@
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/EmbeddedObjects.lyx

@@ -226,7 +226,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/Formula-numbering.lyx

@@ -59,7 +59,7 @@
 \font_tt_scale 100
 
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/Intro.lyx

@@ -75,7 +75,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/LaTeXConfig.lyx

@@ -20,7 +20,7 @@
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/Math.lyx

@@ -196,7 +196,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/Shortcuts.lyx

@@ -47,7 +47,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/Tutorial.lyx

@@ -78,7 +78,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics dvips
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/doc/ja/UserGuide.lyx

@@ -113,7 +113,7 @@ End
 \font_sf_scale 100
 \font_tt_scale 100
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command bibtex
 \index_command default

lib/examples/ja/Braille.lyx

@@ -28,7 +28,7 @@ braille
 \font_tt_scale 100
 
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/examples/ja/FeynmanDiagrams.lyx

@@ -55,7 +55,7 @@
 \font_tt_scale 100
 
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/examples/ja/linguistics.lyx

@@ -28,7 +28,7 @@ linguistics
 \font_tt_scale 100
 
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/examples/ja/splash.lyx

@@ -20,7 +20,7 @@
 \font_tt_scale 100
 
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default

lib/examples/ja/xypic.lyx

@@ -44,7 +44,7 @@
 \font_tt_scale 100
 
 \graphics default
-\default_output_format pdf3
+\default_output_format pdf
 \output_sync 0
 \bibtex_command default
 \index_command default